Поиск по сайту Поиск

Danger, danger, high performance: ускоряем Python по максимуму

Разрушаем мифы и рассказываем, как достичь высокой производительности в программах на Python.

Вот уже более десятка лет Python широко используется как разработчиками, так и исследователями. За счёт своей эффективности и простоты он стал популярен в научных вычислениях и машинном обучении. Однако базовые функции Python — однопоточные. То есть программы на Python не могут одновременно использовать множество процессорных ядер. Как же тогда достичь высокой производительности в анализе данных и машинном обучении на Python?

Язык Python изначально предназначался для введения динамической типизации и предсказуемого, потокобезопасного поведения вместо сложного управления статическими типами и потоковыми примитивами. Для этого в нём используется глобальная блокировка интерпретатора (Global Interpreter Lock, GIL), которая ограничивает выполнение операций только одним потоком за раз. За последнее десятилетие было представлено много реализаций параллельных вычислений для Python, но они не обеспечивали настоящий параллелизм. Означает ли это, что Python — непроизводительный язык? Давайте разберёмся.

Фундаментальные конструкции базового языка для циклов и других асинхронных или параллельных вызовов подчиняются однопоточному GIL. Даже такое определение списка — [x*x for x in range (0,10)] — всегда будет однопоточным. Хотя в языке существует библиотека поддержки потоков, которая многих вводит в заблуждение, на самом деле все операции выполняются в рамках GIL. Почему же в таком выразительном языке присутствуют эти правила?

Причина тому — уровень абстракций, принятый языковой концепцией. В рамках самого Python достижима лишь многопроцессность, то есть параллелизм на уровне отдельных рабочих процессов. Тем самым оказываются потеряны некоторые важные преимущества многопоточности, такие как общий доступ к памяти родительского процесса и сниженные накладные расходы на коммуникацию. Обеспечение многопоточности в Python достижимо посредством «склейки» управляющего Python-кода с библиотеками на других языках, например, на Си. Так, интерфейсы вроде ctypes или cffi повсеместно используются в популярных пакетах NumPy и SciPy для подключения внешних производительных библиотек со встроенной многопоточностью или даже с поддержкой GPU (например, CUBLAS).

Существует ряд других техник повышения производительности Python-программ. Например, доступны следующие фреймворки:

— Numba: допускает JIT-компиляцию кода (Just-in-time), а также может запускать Python-совместимый код на основе LLVM (Low Level Virtual Machine).

— Cython: предоставляет Python-подобный синтаксис со скомпилированными модулями, которые могут использовать аппаратную векторизацию при компиляции в C.

— numexpr: позволяет использовать компиляторы и продвинутую векторизацию для символьных вычислений.

Все они избегают GIL-кода различными способами, сохраняя первоначальную концепцию языка.

Рассмотрим общий пример одной из наиболее распространённых конструкций, к которой мы бы хотели применить параллелизм — цикл for. Посмотрим на фрагмент:

Здесь мы проверяем список list_of_items и возвращаем все числа из него, которые меньше 50.

Запуск этого кода даёт следующий результат:

Python обрабатывает список последовательно с помощью одного потока, поскольку код написан на базовом чистом языке. Здесь мы не наблюдаем никакого параллелизма. Такие конструкции — хорошие кандидаты для фреймворка Numba. Он использует декоратор с символом @, чтобы помечать функции для JIT-компиляции:

Теперь мы получим:

Видно, что производительность повысилась почти вдвое. Дело в том, что исходный код Python написан в примитивах и типах данных, которые могут быть легко скомпилированы и векторизованы для CPU. И первое, на что стоит обратить внимание — это списки. Они бывают очень «тяжёлыми» из-за слабой типизации и встроенного аллокатора. Но если мы посмотрим на типы данных, содержащиеся в random_list, то увидим, что они все целочисленные. Благодаря этой согласованности типов JIT-компилятор Numba может векторизовать цикл.

Если список содержит разнотипные элементы (например, символы и числа), то выполнение кода завершится ошибкой TypeError. Кроме того, если функция содержит операции для смешанных типов данных, Numba не сможет создать высокопроизводительный JIT-код и обратится к объектному коду Python.

Урок здесь заключается в том, что достижение параллелизма в Python зависит от исходного кода. Чистота типов и использование векторизуемых структур данных позволяют Numba распараллеливать код с помощью простого декоратора. Наиболее осторожно следует обращаться со словарями, поскольку обычно они плохо поддаются векторизации. То же относится к генераторам и списковым включениям. Реорганизация их в списки, множества или массивы может облегчить ситуацию.

Гораздо проще достичь параллелизма в числовой и символьной арифметике. NumPy и SciPy отлично справляются с пересылкой вычислений вне GIL-кода на низкоуровневый код С и среду выполнения CUBLAS. Возьмём, к примеру, символьное выражение NumPy ((2 * a + 3 * b) / b):

Выражение многократно использует однопоточный интерпретатор Python из-за структуры библиотеки NumPy. Каждый return из Numpy передаётся в C и затем обратно возвращается на уровень Python. Потом объект Python направляется к каждому последовательному вызову для повторной отправки на C. Эти прыжки туда-сюда создают так называемое «узкое место» в вычислениях. Поэтому, если вы хотите посчитать линейную алгебру, которую тяжело или невозможно описать в Numpy или SciPy, лучшим вариантом будет numexpr:

Как же numexpr достигает почти четырёхкратного ускорения? Он использует символьное представление вычислений для генерации кода, которое работает на уровне функций доступной библиотеки BLAS. В случае BLAS для CPU, код этих функций будет наилучшим образом векторизован; в случае CUBLAS — вычислительную нагрузку примут ядра графического процессора. Так все вычисления остаются в виде низкоуровневого кода до их завершения и возвращения результата обратно на уровень Python. Этот метод также позволяет избежать многократных обращений через интерпретатор Python, сокращая число однопоточных участков кода, а также обеспечивает краткий синтаксис.

Экосистема Python предоставляет много хороших вариантов повышения производительности. Чтобы овладеть ими, важно понимать используемые вами инструменты и ограничения, которые они накладывают. Хотя Python использует GIL для реализации своей языковой концепции, его принципиальную однопоточность легко обойти с помощью правильных методик и эффективного кода.

С оригинальной статьёй можно ознакомиться на сайте techdecoded.intel.io.

Глубокое обучение в авиационной безопасности

Глубокое обучение в авиационной безопасности

Статистика несчастных случаев показывает, что около половины авиакатастроф происходят в конце полёта — во время захода на посадку и самой...
Read More
Серьёзный бизнес или развлечения? Для чего клиенты REG.RU создают сайты

Серьёзный бизнес или развлечения? Для чего клиенты REG.RU создают сайты

Привет читателям нашего блога! Сегодня в жизни REG.RU очень важное событие — компании исполняется 13 лет. И этот год будет точно...
Read More
Панды в Премьер-лиге

Панды в Премьер-лиге

Очень жаль, но панды не играют в футбол. Поэтому в этой статье речь пойдёт о возможностях библиотеки “Pandas”, название которой...
Read More
Нет бэкапа — жди факапа, или Почему важно вовремя делать резервные копии

Нет бэкапа — жди факапа, или Почему важно вовремя делать резервные копии

Люди делятся на три категории: те кто ещё не делает резервные копии, те, кто уже делает, и те, кто проверяет...
Read More
Нейросети VS Правило 34: AI научились скрывать обнажённых людей

Нейросети VS Правило 34: AI научились скрывать обнажённых людей

В одном из эпизодов сериала «Чёрное зеркало» женщина использовала для своей дочери систему, которая блокировала все жестокие, негативные или неподобающие...
Read More
Фантастический домен .COM и кто в нём обитает

Фантастический домен .COM и кто в нём обитает

Домен .COM — безоговорочный победитель в гонке доменных зон. Сейчас в нём зарегистрировано свыше 137 миллионов адресов и это фантастический результат!...
Read More
Генерация аниме с помощью нейросети StyleGAN

Генерация аниме с помощью нейросети StyleGAN

StyleGAN — та самая нейросеть, которая генерирует лица несуществующих людей на сайте thispersondoesnotexist.com. Исследователь Gwern Branwen вывел её на новый уровень...
Read More
Как защитить свой компьютер и смартфон от взлома: советы специалистов REG.RU

Как защитить свой компьютер и смартфон от взлома: советы специалистов REG.RU

Слово редакции: пришло время новых инсайдов и лайфхаков от сотрудников REG.RU! В прошлый раз генеральный директор REG.RU Алексей Королюк делился...
Read More
Danger, danger, high performance: ускоряем Python по максимуму

Danger, danger, high performance: ускоряем Python по максимуму

Разрушаем мифы и рассказываем, как достичь высокой производительности в программах на Python. (далее…)
Read More
Выявление болезни Альцгеймера по речи пациента с помощью ИИ

Выявление болезни Альцгеймера по речи пациента с помощью ИИ

Искусственный интеллект — не только голосовые ассистенты и роботы-художники. Сегодня машинное обучение готово приносить пользу всему человечеству, сохраняя здоровье людей....
Read More